טיפול שורש הינו הליך ברפואת שיניים, אשר נדרש כאשר עששת שהתפתחה לאורך זמן הצליחה לעבור את זגוגית השן ,את שכבת הדנטין והגיעה עד למוך השן .
לעיתים ישנו צורך בטיפול שורש גם לאחר חבלה ו/או פגיעה קשה (שבירה ) , שבה מוך השן נחשף וקיימת רגישות גבוהה ו/או זיהום.

הטיפול כולל פתיחה של השן, סילוק העששת, סילוק המוך וניקוי תעלות השורש, ולבסוף מילוי השן בחומר מיוחד לסתימתה.

טיפול השורש חשוב ביותר, ונועד להציל את השן מעקירה, מאחר וחוסר טיפול עלול להביא להתרחבות הזיהום והגעתו ללסת שבה קבועה השן. סיכויי ההצלחה בביצוע טיפולי שורש גבוהים ותלויים בחומרת המחלה, במבנה השן, ביכולת הריפוי והבריאות של המטופל.

לפני טיפול שורש נדרש לרוב לבצע צילום רנטגן של השיניים, ולעיתים נדרש צילום מיוחד (צילום פנורמי), זאת על מנת לאבחן במדויק את המחלה בשן.